Deltakere av Genome 10K-konsortiet på den årlige konferansen, som nå pågår i New York, kunngjorde lanseringen av det internasjonale prosjektet "Vertebrate Genomes", dets oppgave er å samle genomene til alle 66 tusen virveldyrarter som lever på planeten i dag. Gizmodo forteller mer om prosjektets mål og mål.
I 2009 grunnla amerikanske biologer David Haussler, Oliver Ryder og Stephen O'Brien Genome 10K-prosjektet, hvis mål var å sekvensere 10 000 virvelløse genomer. Opprinnelig deltok 55 forskere fra store dyreparker, forskningssentre og museer i prosjektet. Først var det uklart hvor lang tid det ville ta å samle genomer av tilstrekkelig kvalitet. Men med kostnadene og forenklingen av sekvenseringsmetoder ble det klart at prosjektet ville fullføre oppgavene sine om noen få år. I løpet av de siste tre årene har prosjektdeltakerne sammenlignet hovedteknologiene for DNA-sekvensering og analyse av resultatene som er oppnådd for å velge den som vil skape "platina-genomer".
I går kunngjorde Genome 10K-medlemmer lanseringen av et nytt Vertebrate Genome Project, som tar sikte på å samle mannlige og kvinnelige genomer av 66.000 virveldyrarter. Prosjektet vil involvere 150 forskere som representerer 50 organisasjoner fra 12 land. Ifølge en av grunnleggerne av prosjektet, Oliver Ryder, vil biologer som et resultat kunne forstå årsakene til utryddelse av arter, inkludert om det har vært nært beslektede kryss i artenes historie, "flaskehalser", som et resultat av at artenes genetiske mangfold har redusert eller slettinger - mutasjoner som kan "slå av »Gener som er nødvendige for organismenes overlevelse.
Sammen med kunngjøringen av det nye prosjektet presenterte forskere straks de første resultatene av sitt arbeid: genomene til 15 virveldyrarter, inkludert den truede kakapo ugle papegøyen, endemisk til New Zealand og den australske platypus. Disse og alle andre genomene som forskerne planlegger å samle, vil bli publisert i det offentlige området, i Noahs Ark Genomic-database.
Deltakerne planlegger å sekvensere korte seksjoner av genomisk DNA og samle stadig lengre sekvenser fra dem opp til hele kromosomet, og deretter "lim" dem ved hjelp av algoritmer som er spesielt utviklet for prosjektet.
Tidligere var forskere i stand til å lese en persons genom på en smarttelefonstørrelse lomme sequencer. Enheten satte rekorden for den lengste avlesningen av et DNA-molekyl, den var i stand til å sekvensere sekvenser opptil 882 tusen basepar.
Ekaterina Rusakova
