Nettstedet kjent som "Vector" inneholder koppevirus samt prøver av ebolavirus.
Myndighetene sa at gasseksplosjonen utløste brann i et russisk laboratorium som lagrer virus fra kopper til ebola.
Eksplosjonen skjedde under renoveringen av et sanitær- og hygienisk rom i femte etasje i det statlige forskningssenteret for virologi og bioteknologi - kjent som "Vector" - i Koltsovo, i Novosibirsk-regionen, sa senteret mandag. Nettstedet var vertskap for forskning på biologiske våpen under sovjettiden og er nå et av de viktigste sentrene for sykdomsforskning i Russland.
En arbeider fikk tredjegradsforbrenninger. Brannen med et areal på 30 kvadratmeter ble senere slukket.
Russiske myndigheter insisterer på at det ikke var biofarlige stoffer i rommet der eksplosjonen skjedde.
Kopperokkeviruset eksisterer to steder på jorden: på Vector og i et annet svært sikkert laboratorium ved US CDC i Atlanta.
I 2004 døde en forsker i et laboratoriumkompleks etter at han ved et uhell stakk seg selv med en nål med ebolaviruset.