Forskere har oppdaget et nytt virus i Brasil, hvorav DNA er 90 prosent av gener som er ukjent for vitenskapen. Resultatene av funnet er publisert på bioRxiv-fortrykkstedet.
Viruset ble påvist i den kunstige innsjøen Pampulha i den brasilianske byen Belo Horizonte. Det ikke veldig kompliserte genomet består nesten utelukkende av gener som er ukjente for vitenskapen. Forfatterne oppkalte det nye viruset Yaravirus brasiliensis etter vannynmfen Yara fra mytologien til folkene i Sør-Amerika.
Forskere spekulerer i at de blir møtt med det første tilfellet av en ukjent isolert gruppe virus eller en fjern art av et gigantisk virus som har utviklet seg til en mindre form.
Kjempevirus ble oppdaget først i det 21. århundre, og når størrelser som kan sammenlignes med bakteriene. De fikk navnet sitt på grunn av sine enorme kapsider - proteinmembraner som innkapsler virjoner - virale partikler. De har også DNA med passende lengde, som overstiger 200 tusen basepar og inneholder ofte de såkalte foreldreløse eller foreldreløse gener (ORFan), som ikke finnes i noen annen gruppe organismer.
Komplekse genomer gjør det mulig for gigantiske virus å syntetisere proteiner og utfører derfor DNA-reparasjon, replikasjon, transkripsjon og translasjon. Før oppdagelsen deres ble det antatt at virus ikke har slike evner, siden de er inerte skapninger som bare kan smitte vertene deres. Alle kjente gigantvirus er parasitter av amøber.
Og selv om størrelsen på den nye mikroorganismen er betydelig mindre enn for gigantiske virus - rundt 80 nanometer - parasitterer den også på amøber, og genomet er nesten fullstendig foreldreløst: 68 av genene (mer enn 90 prosent) finner ikke analoger i noen kjent organisme, og bare seks vagt likt de som er kjent for vitenskapen.
En av studielederne, Jônatas Abrahão fra Federal University of Minas Gerais i Brasil, sier en av studielederne, Jônatas Abrahão fra Federal University of Minas Gerais i Brasil.
Forskere har analysert mer enn åtte og et halvt tusen metagenomer, men har ikke funnet blant dem virus relatert til den nye mikroorganismen. Som andre virus i denne gruppen er det representert med dobbeltstrenget DNA, hvis lengde er 44 900 basepar og inneholder 74 kodende fragmenter.
Salgsfremmende video:
"Ved å bruke standardprotokoller var vår første genetiske analyse ikke i stand til å oppdage noen gjenkjennelige kapsidsekvenser eller andre klassiske virale gener i yaravirus," forklarer Yonatas Abrajao og andre studieleder Bernard La Scola ved Aix-Marseille University i Frankrike.
I henhold til de offisielle metagenomiske protokollene kan ikke yaravirus en gang anerkjennes som et viralt middel, fordi det ikke har noen klar likhet med dem. Forskere kan ennå ikke si hva han egentlig er - en representant for en helt ny gruppe eller en etterkommer av et gigantisk virus som på en eller annen måte utviklet seg til en mindre form.
"Antallet ukjente proteiner som utgjør partiklene i yaravirus gjenspeiler variabiliteten som finnes i den virale verden og hvor mange nye virale genomer som ennå ikke er oppdaget," konkluderer forfatterne.
