Tailless DNA-holdige bakteriofager kunne ikke oppdages ved standardmetoder - men nå mener forskere at de dominerer verdens hav.
Hver dråpe vann som ikke er så dypt fra havoverflaten inneholder omtrent 10 millioner virus. Det er neppe overraskende at biologer stadig oppdager nye, selv om oppdagelsen av en helt ny gruppe fremdeles er svært sjelden. Det ser ut til at standardteknikker rett og slett ikke tillot dem å bli lagt merke til, selv om slike virus viste seg å være ekstremt mange - kanskje de er utbredte ikke bare i havet og ganske enkelt unnslått forskere.
Martin Polz fra Massachusetts Institute of Technology og hans kolleger undersøkte vannprøver tatt utenfor den nordamerikanske kysten av Atlanterhavet. De lette etter virus som inneholder dobbeltstrenget DNA - slike virus er ekstremt utbredt, inkludert herpes, og bakteriofagen T4 (Caudovirales) kjent for alle fra skolen. Etter å ha infisert kulturer av marine bakterier Vibrionaceae, oppdaget forskere 200 forskjellige DNA-virus, hvorav 18 ble tilskrevet den nye ordren Autolykiviridae. De skriver om dette i en artikkel publisert i tidsskriftet Nature.
Gruppens navn viser til helten fra den greske mytologien Autolycus, en utspekulert tyv som er like vanskelig å fange som disse virusene. "De vanligste virusene på jorden er bakterieinfiserende virus som inneholder dobbeltstrenget DNA," skriver Poltz og hans medforfattere.”Caudovirales med virvler med haler som har haler, som dominerer databasene og avlingene, er imidlertid ikke representative for deres tilstedeværelse i miljøet. Faktisk dominerer smaksfrie virus vannprøvene."
Bakterieceller infisert med Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
"Tailless" -bakteriofager Autolykiviridae utmerker seg med en liten genomstørrelse - bare rundt 10 tusen baser, 4-5 ganger mindre enn hos "halet" pårørende. Deres evne til å infisere og drepe bakterieceller var også uvanlig. Hvis vanlige fager i eksperimenter, som regel, påvirket en spesifikk arter av vibrios, smittet disse i gjennomsnitt fire og førte til en merkbart høyere celledød. "Det ble funnet at de var ansvarlige for 40 prosent av bakteriedødsfall, selv om de utgjorde omtrent 10 prosent av det totale antallet virus i prøven," forklarer en av forfatterne av arbeidet.
Vibriobakterier av forskjellige arter er plassert langs omkretsen av diagrammet; sirklene av virus som infiserer dem er assosiert med dem: blå - "tailed" bakteriofager, oransje - "tailless" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Disse tallene indikerer den store rollen den nye gruppen Autolykiviridae spiller i reguleringen av bakteriepopulasjoner og i biosfæren som helhet. Forskere er sikre på at teknikken deres vil bidra til å finne virus som tidligere har sluppet unna påvisning i jorden, og muligens i den menneskelige tarmen. Tilsvarende genetiske sekvenser finnes faktisk i genomene til bakterier i den menneskelige mikrofloraen.
Salgsfremmende video:
Sergey Vasiliev
