Av de ekstra symptomene som er rapportert i rapportene, er det relativt vanlig å nevne alvorlig hodepine, noen ganger i flere dager etter UFO-kontakt. Dette var tilfelle med en 15 år gammel gutt i Brasil, som i flere minutter observerte tre store UFO-navter som gikk av fra to kjøretøy og snakket om noe seg imellom før de så på begge kjøretøyene. Etter at UFO tok av, hadde tenåringen en alvorlig hodepine som varte i omtrent fem dager, ingen medisiner hjalp tenåringen. I dette tilfellet kan vi også snakke om effekten av mikrobølgeenergi: det er bevis på at mikrobølger forårsaker hodepine, som det ble vist i verkene til Milroy og Michaelson i 1971.
Svært sjelden har UFO-observatører rapportert delvis eller fullstendig tap av synet. I denne forbindelse er saken om en 37 år gammel amerikansk statsborger bosatt i Pennsylvania typisk. I tjue minutter så han på en stor skive mot månens bakgrunn, som et resultat av at øynene hans såret, synet ble uklart og gradvis mistet han det helt. Synet ble fullstendig gjenopprettet (tilbake til det normale) først etter noen få dager. Det er kjent at det menneskelige øye er veldig følsomt for mikrobølgestråling, som lett tas opp av væsken inne i øyeeplet, og som et resultat stiger temperaturen på selve væsken og øyeeplet som helhet, og dette kan forårsake grå stær i øyets linse, eller tetting av selve den intraokulære væsken.
I tillegg brente hele huden hans, som om det var et resultat av en solbrenthet: etter all sannsynlighet fikk offeret en slags "forbrenning" av mikrobølgeenergien som ble absorbert av huden hans.
I tillegg til disse rent fysiologiske reaksjonene på effekten av UFO-er, er det mange fakta i rapportene som indikerer at et møte med et objekt i seg selv er et enormt sjokk for mange observatører. Mennesker kan ubevisst falle i en hysterisk tilstand, de kan oppleve uvanlige sensasjoner i form av varme, uvanlige lukter og smak, de kan drømme, mens de opplever fantomagoriske visjoner. Alle disse reaksjonene på stress er av rent psykologisk opprinnelse og bør ikke forveksles med de direkte fysiologiske effektene som er omtalt ovenfor.
