Noe mystisk ble ofte flettet inn i flyene til Apollo. Apollo 12 ble ledsaget av to lysende UFOer i løpet av de tre banene rundt månen. Apollo 13-oppdraget var fullstendig mislykket. På månen begynte mystiske lys å hjemsøke ham. 13. april 1970 eksploderte uventet en oksygentank om bord, og astronautene måtte forlate månelandingen i Fra Mauro-krateret.
Det er en versjon om at oksygenbeholderen ble sprengt av en UFO, og forhindret amerikanerne i å bringe en atombombe til månen for seismisk forskning. Som et resultat av denne ulykken klarte astronauter bare med store vanskeligheter å komme inn i bane på lav jord og vende tilbake til hjemplaneten. Apollo 15-oppdraget observerte en enorm UFO som langsomt fløy over måneoverflaten. Til slutt oppdaget Apollo 16-sjef John Young et pent glassprisme i månestøvet, anslått til å være milliarder år gammelt.
I 1996 ble en bok av Dr. Edwin Rice, en av forfatterne av Apollo 17-prosjektet, med tittelen "Lost Space" utgitt i USA. Rais hevdet at astronautene på denne ekspedisjonen møtte visse innbyggere på månen. Mens de reiste på overflaten av planetens satellitt på Rover, møtte de angivelig en liten, kuppelformet struktur på omtrent tre meter, hvorfra plutselig strømmet et titalls rare skapninger ut. De gjorde ikke noe forsøk på å angripe kjøretøyet, men det opphørte plutselig å adlyde astronautene. Samtidig hørtes det en klar, klangfull tale i hodetelefonene deres, som ble videreformidlet til Houston, hvor den umiddelbart ble oversatt fra latin.
Det viste seg at skapningene fortalte astronautene at de hadde invadert fremmed territorium, og at de skulle reise hjem. Så snart alle og alt forstod, ble kontrollen over Rover gjenopprettet, og jordboerne stormet til sitt månefartøy.
