Forskere har oppdaget en familie av unike korte repetisjoner i grisegenomet som har evolusjonære likheter med lignende repeter hos primater.
Forskere fra Jilin University (Changchun, Kina) og Academy of Agricultural Sciences (Heilongjiang, Kina) deltok i prosjektet i samarbeid med Firefly BioWorks Corporation (USA).
Etter å ha analysert strukturen og opprinnelsen til PRE-1 (repeteringselement for svin, bokstavelig talt - "gris gjentatt element"), kom de til den konklusjonen at de nærmeste slektningene til primater på det tidligere superkontinentet Laurasia kunne være griser. Forskningstrykket ble publisert på bioRxiv-serveren 31. august 2015.
Den studerte CDP (kort spredt repetisjon) PRE-1 er lokalisert i den intergene regionen, omtrent 686 ~ 985 basepar før starten på genet som koder for insulin vekstfaktor bindende protein (IGFBP7). Den gjentatte PRE-1-sekvensen på 299 basepar ble sammenlignet med 40 forskjellige primat-Alu-repetisjoner, og signifikante likheter ble funnet både i selve sekvensene og i mønsteret for fordelingen av repeteringen deres over kromosomer.
Den forutsagte sekundære strukturen til RNA gjentar PRE-1 brettet til en modell som ligner Alu-gjentagelsene. Til slutt foreslo den vanlige opprinnelsen til PRE-1 og Alu fra det såkalte 7SL RNA (signalgjenkjennings-RNA) deres evolusjonære likhet og tilskrev griser til familien, som hovedsakelig inkluderer primater.
Tidligere, for å bygge fylogenetiske trær, stolte forskerne bare på likhetene og forskjellene mellom gener, og ignorerte det faktum at hele genomet gjennomgikk endringer i løpet av evolusjonen, inkludert de elementene som ikke koder for proteiner eller RNA, og hvis betydning fremdeles er uklar for forskere.
Kampanjevideo:
Denne studien, basert på en integrert tilnærming til analysen av intergeniske elementer, gir ifølge forfatterne "veldig overbevisende" fakta som evolusjonære konklusjoner kan trekkes fra. Spesielt, ifølge disse resultatene, skifter den estimerte tiden for avvik fra arter fra 65 til 80-100 millioner år siden.
